A contabilidade para fisioterapeutas costuma ser tratada como detalhe burocrático, até o dia em que o fisioterapeuta descobre que está pagando o dobro de imposto que precisaria, ou recebe uma notificação porque emitiu nota errado. É um problema que se repete. Como cirurgião-dentista e cofundador da Biank, lido com profissionais da saúde que são excelentes no atendimento e, na parte tributária, foram empurrados por um contador generalista para o pior enquadramento possível.
Este guia reúne, num lugar só, o que um fisioterapeuta precisa entender para cuidar da contabilidade da sua atividade com segurança: quando ainda vale a pena atuar como pessoa física, quando abrir empresa, qual regime escolher, como o Fator R pode cortar seu imposto pela metade, o que o CREFITO exige e como emitir nota do jeito certo.
Por que o fisioterapeuta precisa de contabilidade especializada
Fisioterapia é uma profissão regulamentada, com conselho próprio — o CREFITO (Conselho Regional de Fisioterapia e Terapia Ocupacional) — e particularidades tributárias que um contador que atende padaria, loja e oficina raramente domina. O resultado prático: dois fisioterapeutas com o mesmo faturamento podem recolher valores muito diferentes de imposto só pela forma como cada um está estruturado.
E não estou falando de sonegar. Estou falando de planejamento tributário dentro da lei: escolher o regime certo, enquadrar no anexo certo, aproveitar o que a legislação já permite.
Os erros que mais aparecem entre os fisioterapeutas que chegam à Biank são quase sempre os mesmos:
- Continuar como pessoa física quando o faturamento já justifica abrir CNPJ.
- Cair no Anexo V do Simples Nacional e pagar 15,5% quando poderiam pagar 6%.
- Tentar abrir MEI, que, como você vai ver, é proibido para a profissão.
- Misturar conta pessoal e da clínica, sem saber quanto realmente sobra no fim do mês.
- Ignorar a parte do CREFITO na hora de abrir a empresa e travar a regularização.
Fisioterapeuta pode ser MEI? Não — e isso muda tudo
Vamos tirar essa dúvida logo no começo, porque é a origem de boa parte da confusão: fisioterapeuta não pode ser MEI.
O MEI (Microempreendedor Individual) foi criado para atividades de natureza mais simples, que não exigem formação superior nem registro em conselho profissional. A fisioterapia é o oposto disso: exige diploma de nível superior e registro no CREFITO. Por isso, a atividade não consta na lista de ocupações permitidas ao MEI.
Na prática, qualquer tentativa de cadastrar um MEI com atividade de fisioterapia é irregular: o CNPJ pode ser cancelado, e ainda há risco de multas e cobranças retroativas. Não vale a pena.
O caminho correto é abrir uma empresa em outro formato, geralmente uma Sociedade Limitada Unipessoal (SLU) ou um Empresário Individual (EI), quase sempre dentro do Simples Nacional. Trato o passo a passo disso no guia sobre como abrir o CNPJ de fisioterapeuta.
Pessoa física ou CNPJ: quando vale a pena abrir empresa
Muito fisioterapeuta começa atendendo como autônomo, recolhendo o Carnê-Leão sobre o que recebe de pessoa física. No início, faz sentido: o volume é pequeno e a estrutura de empresa traria custo desnecessário.
O problema é que a tributação da pessoa física sobe rápido. O Carnê-Leão segue a tabela progressiva do Imposto de Renda, que chega a 27,5% sobre a parcela mais alta da renda. Já uma empresa bem enquadrada no Simples Nacional começa em 6%. Conforme o faturamento cresce, a diferença vira dinheiro de verdade saindo do seu bolso.
Um exemplo simples. Um fisioterapeuta que fatura R$ 12.000 por mês como pessoa física pode ver boa parte desse valor sendo tributada nas faixas mais altas do IRPF. A mesma renda, dentro de uma empresa no Anexo III do Simples, é tributada a partir de 6%. A economia anual costuma passar de cinco dígitos.
Além do imposto, ter CNPJ traz outras vantagens: separa as finanças pessoais das da clínica, dá credibilidade para fechar com convênios e parcerias, e permite contratar. Há um detalhe importante para o fisioterapeuta: a pessoa física não pode emitir nota de pessoa jurídica nem firmar certos contratos que clínicas, hospitais e planos costumam exigir. Isso, sozinho, já empurra muita gente para o CNPJ.
Não existe regra mágica de “a partir de X reais abra empresa”. O ponto de virada depende do seu faturamento, das suas despesas dedutíveis e de quanto de folha você consegue ter. Por isso a gente simula os dois cenários antes de decidir.
Os regimes tributários do fisioterapeuta (e como escolher)
Depois de decidir pelo CNPJ, vem a escolha do regime. Para a fisioterapia, dois caminhos concentram a maioria dos casos.
Simples Nacional
É o regime mais comum para clínicas e consultórios de fisioterapia de pequeno e médio porte, com teto de R$ 4,8 milhões de faturamento por ano. A grande questão aqui é o anexo em que a atividade será tributada:
- Anexo III: começa em 6% (a alíquota mais baixa);
- Anexo V: começa em 15,5% (mais que o dobro).
O CNAE de atividades de fisioterapia (8650-0/04) não cai automaticamente no Anexo III: ele está sujeito ao Fator R. Ou seja, qual anexo você paga depende da relação entre a sua folha de pagamento e o seu faturamento. É o ponto mais importante deste guia, e por isso tem seção própria logo abaixo.
Lucro Presumido
Para clínicas com faturamento maior ou folha enxuta, o Lucro Presumido pode ser mais vantajoso. Nele, presume-se que 32% do faturamento de serviços é lucro, e sobre essa base incidem IRPJ (15%, mais adicional de 10% sobre o que exceder R$ 20 mil de lucro presumido por mês) e CSLL (9%), além de PIS (0,65%), COFINS (3%) e o ISS municipal (de 2% a 5%).
Não dá para escolher no “achismo”. A diferença entre Simples e Presumido pode ser de milhares de reais por ano, e depende dos seus números reais. O caminho é simular os dois com os seus dados.
O Fator R: o maior aliado do fisioterapeuta no Simples
Se você ler só uma parte deste guia, que seja esta. O Fator R é a regra que decide se sua clínica paga 6% ou 15,5% sobre o mesmo faturamento.
O cálculo é a razão entre a sua folha de pagamento dos últimos 12 meses e o seu faturamento dos últimos 12 meses. A folha inclui salários, o pró-labore (seu próprio salário como sócio), 13º, férias, mais o INSS patronal e o FGTS.
A regra:
- Folha igual ou maior que 28% do faturamento → Anexo III (6%);
- Folha abaixo de 28% → Anexo V (15,5%).
O detalhe que pega quase todo fisioterapeuta: para “tirar menos imposto”, muita gente define um pró-labore baixinho e, sem perceber, joga a própria empresa para o Anexo V, o mais caro. Ajustar o pró-labore de forma planejada costuma reduzir bastante a carga tributária, dentro da lei e com o devido recolhimento de INSS (que, de quebra, vira a sua contribuição para a aposentadoria).
Esse é um cálculo que muda todo mês, porque usa os 12 meses anteriores. Por isso ele precisa de acompanhamento mensal, não de uma conta feita uma vez por ano. Detalhei tudo o que é específico da profissão no guia sobre o Fator R do fisioterapeuta, e o mecanismo completo da regra está no nosso material sobre como o Fator R funciona em detalhe.
O que o CREFITO exige da sua empresa
Aqui mora uma diferença em relação a profissões não regulamentadas. Não basta abrir o CNPJ na Junta Comercial e na Receita: toda empresa cujo objeto seja prestar serviços de fisioterapia precisa de registro no CREFITO da região onde atua.
Junto com o registro de pessoa jurídica, vem a exigência de um responsável técnico: um fisioterapeuta inscrito no CREFITO que responde tecnicamente pela empresa. Se você é fisioterapeuta e dono da clínica, normalmente você mesmo assume esse papel. Mas a regra existe e o registro precisa estar em dia para a empresa operar regularmente.
Esse é justamente o tipo de detalhe que um contador generalista deixa passar, e que trava a regularização lá na frente. Reuni o que o conselho e o fisco esperam da sua empresa no artigo sobre o que o CREFITO exige da sua empresa.
Emissão de nota: como o fisioterapeuta declara o que recebe
Todo fisioterapeuta precisa documentar o que fatura. A forma depende de como você atua.
Para quem atende como pessoa física, a Receita Federal disponibiliza a Receita Saúde, um recibo eletrônico que integra automaticamente ao Carnê-Leão e à declaração de Imposto de Renda. Isso reduz o risco de cair na malha fina e ainda entra na declaração pré-preenchida do paciente. Vale entender as vantagens em Receita Saúde.
Para quem tem CNPJ, a emissão é de NFS-e municipal a cada atendimento. Organizar bem esses recebimentos não é só obrigação fiscal: é o que permite calcular corretamente o Fator R e o imposto devido mês a mês.
Organização financeira: o que separa a clínica que cresce
Imposto resolvido, ainda falta a parte que decide se a clínica prospera ou vive no sufoco: organizar o que de fato sobra. As práticas que mais fazem diferença:
- Separar pessoa física e jurídica. A conta da clínica é da clínica; o seu pró-labore é o seu salário. Misturar os dois é a forma mais rápida de perder o controle.
- Controlar o fluxo de caixa. Saber o que entra e o que sai de verdade, incluindo taxas de máquina, repasses de parcerias e custos fixos do consultório.
- Reservar para os impostos. Separar o valor dos tributos a cada recebimento evita o aperto na data do vencimento do DAS.
- Acompanhar o Fator R. Como ele muda todo mês, um faturamento alto sem ajuste de folha pode te empurrar de volta para o Anexo V no pior momento.
Como a Biank cuida da contabilidade do fisioterapeuta
A Biank é uma contabilidade digital especializada em saúde. Quem assina e revisa o que você lê aqui vive a rotina da área: o Dr. Jean Santos é cirurgião-dentista (CRO-PR 18633), e toda a parte tributária passa pela revisão da contadora Wanessa Nolli (CRC-PR). Na prática, isso significa orientação de quem entende tanto da realidade clínica quanto do fisco, a combinação que faz diferença na hora de defender cada real que você pode economizar legalmente.
Se você está começando a estruturar a parte contábil da sua atividade, comece pela decisão mais importante: como abrir o CNPJ de fisioterapeuta do jeito certo desde o primeiro dia.
Perguntas frequentes sobre contabilidade para fisioterapeutas
Fisioterapeuta pode ser MEI? Não. A fisioterapia é profissão regulamentada, com registro obrigatório no CREFITO, e não consta na lista de ocupações permitidas ao MEI. O caminho é abrir empresa em outro formato (em geral SLU ou EI), normalmente no Simples Nacional.
Qual o melhor regime tributário para fisioterapeuta? Depende do faturamento, da folha e da estrutura. Na maioria das clínicas pequenas e médias, o Simples Nacional no Anexo III (via Fator R) é o mais econômico, mas o Lucro Presumido pode vencer em alguns casos. O ideal é simular os dois.
Qual o CNAE da fisioterapia? O CNAE principal é o 8650-0/04, Atividades de fisioterapia. Ele está sujeito ao Fator R no Simples Nacional, então não cai automaticamente no Anexo III.
Preciso registrar a empresa no CREFITO? Sim. Além do registro na Junta Comercial e na Receita, a empresa que presta serviços de fisioterapia precisa de registro no CREFITO da sua região e de um responsável técnico fisioterapeuta inscrito no conselho.
Vale a pena sair de autônomo para CNPJ? Quando o faturamento cresce, quase sempre sim. A tributação da pessoa física tende a ficar mais cara que a de uma empresa bem enquadrada, além das vantagens de organização, credibilidade e dos contratos que só uma PJ consegue firmar.
Conteúdo com finalidade informativa, atualizado em 10/06/2026. Para a sua situação específica, consulte um contador. Autoria: Dr. Jean Santos (CRO-PR 18633). Revisão técnica: Wanessa Nolli (CRC-PR).
